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2019年10月23日 星期三
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茶树高密度遗传图谱构建取得重要进展
来源:中国农业科学院茶叶研究所
       遗传图谱既是茶树遗传研究的重要手段,又是加速茶树分子标记育种的有力工具。长期以来,由于作图群体类型和分子标记数量的限制,已构建的茶树遗传图谱在标记密度、基因组覆盖度等方面都有待提高。
       近日,中国农业科学院茶叶研究所茶树种质资源创新团队构建了首张茶树高密度遗传图谱。该团队采用简化基因组测序技术对一个F1全同胞家系进行高通量测序,获得了101091个高质量的序列标签,随后通过基因型编码开发出18846个SNP标记,剔除亲本信息缺失、完整度过低和不适合该群体作图的多态性标记后,获得6042个可用于构建图谱的SNP标记,并联合406个SSR标记构建了包含15个连锁群、3973个位点(包含1470个bin和2543个单标记)、总图距3965 cM、标记间平均距离为1.0cM的高密度遗传图谱。同时,通过等位基因和合子偏分离检验还发现,该作图群体中81.5%偏分离标记是由配子选择引起的,4.9%由合子选择导致的,10.0%由配子和合子共同选择导致的。研究结果在最近一期《PLoS One》(《公共科学图书馆-综合》)(doi:10.1371/journal.pone.0128798)上发表。
  该研究构建的高密度遗传图谱为进一步开展茶树QTL精细定位、基因图位克隆和分子标记辅助育种等研究提供了平台。

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